菌群失调（Dysbiosis）是2023年新增的衰老标志，指肠道微生物组多样性和组成随年龄发生的不利变化，表现为有益菌减少、促炎菌增加和微生物代谢产物谱改变。肠道菌群通过肠-脑轴、肠-免疫轴和肠-肝轴影响全身健康，菌群失调与慢性炎症、代谢综合征和神经退行性变密切相关。
菌群失调指肠道微生物组的组成和功能偏离健康状态，表现为多样性降低、有益菌（如双歧杆菌、阿克曼菌）减少、潜在致病菌增加以及微生物代谢产物（短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸代谢物）组成改变。2023年López-Otín团队将其新增为衰老标志。
肠道菌群通过三条主要途径影响全身：(1)肠-免疫轴——菌群代谢产物调节免疫细胞功能；(2)肠-脑轴——迷走神经和微生物神经递质影响认知和情绪；(3)代谢途径——短链脂肪酸（丁酸）调控能量代谢和表观遗传。菌群失调导致肠屏障功能下降（"肠漏"），内毒素入血加剧慢性炎症。
策略包括：增加膳食纤维摄入（有益菌的"食物"）、发酵食品（酸奶、泡菜、纳豆）、减少超加工食品和精制糖、规律运动（增加菌群多样性）、避免不必要的抗生素使用。某些益生菌和益生元补充剂也可能有益。百岁老人的菌群特征是多样性高、富含有益菌种。
DeepoMe通过DNA甲基化数据，间接评估肠道菌群-宿主互作相关通路的衰老状态，包括炎症信号、免疫调节和代谢通路的菌群响应能力。这种方法为菌群-宿主互作研究提供了宿主侧的分子视角。
Hallmarks of Aging
衰老标志（Hallmarks of Aging）是国际公认的衰老机制分类框架，最初由López-Otín等人在2013年Cell期刊提出（9大标志），2023年更新为12大标志，2025年再次更新为14大标志。DeepoMe是全球首个将衰老标志特征直接检测技术实现产品化的公司，通过Capome®产品量化评估个体的衰老标志状态，而非群体平均推算。
Chronic Inflammation
慢性炎症（Chronic Inflammation），又称炎性衰老（inflammaging），是衰老的整合标志之一，指随年龄增长出现的低度、全身性、慢性炎症状态。其特征为循环中促炎因子（CRP、IL-6、TNF-α）水平升高，与心血管疾病、神经退行性变、2型糖尿病和癌症等多种衰老相关疾病密切相关。
Altered Intercellular Communication
细胞间通讯改变（Altered Intercellular Communication）是衰老的整合标志之一，指细胞间信号传递方式随年龄发生的改变，包括促炎信号增加、神经内分泌改变和免疫通讯紊乱。这种改变导致组织协调性下降，是"炎性衰老"（inflammaging）和免疫衰老的上游机制。
Metabolic Aging
代谢老化（Metabolic Aging）指代谢系统随年龄增长出现的功能衰退，包括胰岛素敏感性下降、线粒体产能效率降低、脂质代谢紊乱和代谢灵活性减弱。代谢老化是2型糖尿病、心血管疾病和代谢综合征的共同前驱状态。DeepoMe的Capome®可检测12项代谢老化指标，从分子层面评估代谢健康。